Aby wszystkim żyło się lepiej, gracze podzieleni są na grupy, które określają gdzie dana postać jest fabularnie, np. w akademii, czy też jest już obywatelem miasta z dyplomem ukończenia tejże placówki. Kolor przynależności do danej grupy, gracz otrzymuje wraz z zaakceptowaniem kp. Oto następujący podział, który może pomóc dostać się do wybranego "Domu":

Czerwony Slifer - cechuje ich spontaniczność, wybuchowość bądź też jak kto woli porywczość. Przyjaciele ponad wszystko to również ważny aspekt tego domu. Tutaj najłatwiej znaleźć przyjaciół, zacząć przygodę z grą w karty, czy też znaleźć tag team partnera do turniejów, ewentualnie weekendów tag teamowych. Lubią się z graczami Ra i mają mieszane stosunki z Obeliskami, to już zależy od pojedynczych osób. Ich opiekunem jest Yugi Muto.
Obecni członkowie: 4/5
- Aitidel
- Wabik
- Kyoryoku
- Jekyll

Elita Czerwonego Slifera - jest to kilku najlepszych graczy należących do Czerwonego Slifera. Zasłużyli się oni dla szkoły, wygrali jakiś turniej, ewentualnie mają kilkadziesiąt wygranych walk. Nie muszą chodzić na zajęcia, reprezentują szkołę w otwartych rozgrywkach, przeważnie są to uczniowie na ostatnim roku, którzy mają "przepustkę" do świata gier.
Obecni członkowie: 0/5

Niebieski Obelisk - dosłowne i w przenośni przeciwieństwo Czerwonego Slifera. Spokojni, aroganccy, a zarazem przeraźliwie groźni. Nie spoufalają się z nikim z akademii, czasami nawet obcy są sami dla siebie. Wyraźnie dają się wszystkim we znaki przez swoją nieufność, a zarazem pewność siebie. Nie lubią Sliferów i mają mieszane stosunki z Ra, przeważnie jednak pozytywne. Ich opiekunem jest Seto Kaiba.
Obecni członkowie: 4/5
- Cloud
- Shadow
- Rokudo Mukuro
- Chiisai

Elita Obelisku - jest to kilku najlepszych graczy należących do Niebieskiego Obeliska. Zasłużyli się oni dla szkoły, wygrali jakiś turniej, ewentualnie mają kilkadziesiąt wygranych walk. Nie muszą chodzić na zajęcia, reprezentują szkołę w otwartych rozgrywkach, przeważnie są to uczniowie na ostatnim roku, którzy mają "przepustkę" do świata gier.
Obecni członkowie: 0/5

Żółty Ra - gdyby nie oni, można by powiedzieć, że pozostałe grupy by się pozabijały. To oni pilnują porządku w akademii, są najlepszą drużyną, a zarazem każda indywidualność tego domu jest bardzo silna. W tym domu pojawiają się najczęściej indywidualiści, którzy mają w sobie coś i ze Slifera i z Obeliska. Przeważnie trafiają tutaj ci, których nie wiadomo gdzie tak naprawdę wysłać. Mają dobre stosunki i z Sliferami i z Obeliskami. Ich opiekunem jest Marik Ishtar.
Obecni członkowie: 5/5
- Vince
- Kazuyuki
- Ian Locke
- Kitai
- Jetstream

Elita Żółtego Ra - jest to kilku najlepszych graczy należących do Żółtego Ra. Zasłużyli się oni dla szkoły, wygrali jakiś turniej, ewentualnie mają kilkadziesiąt wygranych walk. Nie muszą chodzić na zajęcia, reprezentują szkołę w otwartych rozgrywkach, przeważnie są to uczniowie na ostatnim roku, którzy mają "przepustkę" do świata gier.
Obecni członkowie: 0/5

Nauczyciele - są to absolwenci akademii, którzy postanowili zostać tu na stałe i nauczać przyszłe pokolenia mistrzów. Są nimi między innymi Yugi, Kaiba, Marik, czy też Joey. Przeważnie jeden z nich jest opiekunem danego domu, pozostali zaś ich pomocnikami, którzy pilnują ładu i porządku w całej akademii.
Obecni członkowie: 5/5
- Yugi Muto
- Seto Kaiba
- Marik Ishtar
- Joey Wheeler
- Maximillion Pegasus

Mieszkańcy Miasta - absolwenci szkoły, bądź zwyczajni mieszkańcy miasta, którzy lubią sobie od czasu do czasu zagrać w Pojedynki Potworów. Niektórzy należą do jakichś organizacji, inni prowadzą sklepy, jeszcze inni nawet nie grają w karty. Zależne od woli danego człowieka.
Obecni członkowie: 0/5